Podstawowe etapy diagnozy organizacyjnej to:

• ustalenie (konstatacja) – sprowadza się do zebrania informacji. Trzy podstawowe źródła to: dokumentacja, procesy pracy i pracownicy.
• zweryfikowanie – ocena ustalonych danych co do aktualnych rezultatów funkcjonowania organizacji – porównanie danych, zbieżność praktyki z zakładanymi regułami działania, procedurami i normami.
• ocena – pod kątem zdolności organizacji do realizacji swoich celów.

Proces ten przewiduje powroty i sprzężenia zwrotne umożliwiające weryfikację i uzupełniane diagnozy organizacyjnej.